Es el encargado de la capacitación técnica de estudiantes en el procesamiento de cárnicos, lácteos, frutas y verduras bajo la estrategia metodológica del aprender haciendo. Compuesto por cuatro unidades productivas y de enseñanza (planta lechera, planta de cárnicos, planta de frutas y hortalizas y laboratorio de control de calidad).
El objetivo principal del departamento de Biotecnología es el de impartir conocimiento, a través de la enseñanza teórico-práctica sobre Biotecnología Agrícola, a jóvenes educandos de la ENA.
Realiza su quehacer educativo a través de las áreas de formación de Horticultura, Fruticultura, Granos Básicos y Riegos, acorde al plan de estudios vigentes, atendiendo en este departamento a la población estudiantil en el desarrollo de las asignaturas de Técnicas y Prácticas Agropecuarias de la carrera de Agrónomo en Grado de Técnico, ejecutado por un equipo especializado en las áreas de formación.
El departamento de Zootecnia está integrado por unidades de enseñanza productiva Unidad de Especies Mayores que comprende: ganado lechero y ganado de carne, Avicultura, Pastos y Forrajes, Unidad de Especies Menores que incluye: Suinotecnia, Piscicultura, Cunicultura, Apicultura y Ovicaprinos y la Unidad de Sanidad Animal y Fabrica de Concentrado que comprende Sanidad Animal y Fabrica de Concentrados.
